Прошлые записи

Культивированны штаммы

Культивированны штаммыИз 44 культивированных штаммов М. Tuberculosis 5 из 6 рифампицин-устойчивых штаммов были верно определены исследованием ПЦР-УГД. Образец, давший отрицательный результат на исследовании ПЦР-УГД, но устойчивый по культуре, содержал штамм, не имевший мутаций гена ГроВ. Как указывают авторы, наиболее экономически эффективным будет применение этого исследования в референс — лабораториях, получающих большие количества образцов, поскольку это даст возможность снизить затраты на один образец.

Исследование «Лайн Проуб» — коммерческий тест для экспресс-выявления комплекса М. Tuberculosis и устойчивости к рифампицину. LiPA основано на гибридизации амплифицированной ДНК культивированных штаммов или клинических образцов с десятью зондами, содержащими основной участок гена ГроВ М. Tuberculosis, с последующей иммобилизацией на полоске нитроцеллюлозы. Отсутствие гибридизации амплифицированной ДНК с каким-либо чувствительным, специфичным для исходной последовательности, зондом указывает на мутацию, которая может кодировать устойчивость. В свою очередь, если происходит гибридизация с зондами, специфичными для мутаций, имеет место мутация. В оригинальном исследовании Де Бинхаувера с соавт. результаты LiPA совпали с классическим исследованиям для 65 из 67 образцов. Согласно результатам дальнейших испытаний этой методики Кукси с соавт. на коллекции из 51 рифампицин-устойчивого штамма, общий процент совпадений с фенотипическим исследованием чувствительности составляет 90,2%. Россо с соавт. исследовали 107 изолятов М. Tuberculosis с известной последовательностью гроВ, 52 штамма, не принадлежащих к комплексу М. Tuberculosis, а также 61 чувствительный и 203 устойчивых клинических изолята. Их результаты показывают, что специфичность зонда для комплекса М. Tuberculosis Составляет 100%; по сравнению с результатами секвенирования расхождений отмечено не было. Более того, все штаммы, классифицированные как чувствительные при исследовании In Vitro, были определены верно, а среди устойчивых штаммов только по 2-м процентам были получены сомнительные результаты. Впоследствии Гамбоа с соавт. провели испытания LiPA на 59 образцах, содержащих М. Tuberculosis , и обнаружили соответствие на 98,3% с ИЛЧ изолированных штаммов. Однако, как и в случае со всеми другими коммерческими методами, высокая стоимость тестовых материалов может ограничить использование методики во многих развивающихся странах.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Популярное

Copyright © 2015. All Rights Reserved.