Прошлые записи

Определение геномной последовательности

Определение геномной последовательностиБыло бы весьма интересно изучить возможность вмешательства в другие фазы жизненного цикла палочки помимо репликации, которая является мишенью для многих современных видов терапии. Недавнее завершение определения геномной последовательности Mycobacterium Tuberculosis H37Rv позволит нам проводить идентификацию таких мишеней и оптимизацию базовых структур с невиданной ранее скоростью. В геноме М. Tuberculosis существует более 4000 открытых рамок считывания, а последние успехи методик построения микроматриц на иммобилизированной ДНК позволили создать матрицы, отражающие 97% этих генов. При помощи этих матриц стало возможным определить транскрипционную реакцию клетки на лечение такими противотуберкулезными препаратами первого ряда, как изониазид. В этих исследованиях, а также в экспериментах с другими антибиотиками обнаруживается множество пересекающихся механизмов регуляции, некоторые из которых ингибируют отдельный фермент или путь метаболизма, другие же обеспечивают реакцию на более общий стресс, вызывая, к примеру, тотальное снижение метаболизма. Между двумя этими крайностями находятся регуляторные сети, отражающие группы генов, контролируемые на уровне транскрипции и задействованные на определенных участках метаболизма, например в структуре и функции клеточной стенки. Следовательно, в эксперименте возможно отследить в зависимости от времени и концентрации те различные события, которые, собственно, и привели к гибели клетки, начиная от конкретных реакций на уровне транскрипции и ингибирования отдельных ферментов и кончая общей картиной полного разрушения микроорганизма. Этот набор молекулярных «отпечатков пальцев» дает нам ключ к пониманию подробностей механизма действия препарата.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Популярное

Copyright © 2015. All Rights Reserved.