Прошлые записи

Последовательность участка

Последовательность участкаОдин из новых подходов к генотипическому выявлению устойчивости основан на гибридизации амплифицированной ДНК с обладающими высокой плотностью олигонуклеотидными матрицами на миниатюрной стеклянной основе, что позволяет исследовать большие количества последовательностей за один шаг гибридизации. Гингерас с соавт. построили матрицу для определения специфической нуклеотидной последовательности участка гена гроВ из 705 пар оснований, с помощью которой было проведено определение устойчивости к рифампицину у 44 исследованных штаммов. Кроме того, они смогли выполнить генотипирование и видовую идентификацию нетуберкулезных изолятов. Впоследствии Трёш с соавт. использовали ту же технологию для видовой идентификации микобактерий и определения устойчивости к рифампицину с применением двух баз данных последовательности ДНК. Путем гибридизации амплифицированного генетического материала с флюоресцентной меткой из колоний микобактерий было определено 27 различных видов, а устойчивость к рифампицину была выявлена у 15 исследованных штаммов. Как сообщают Хэд с соавт. , для преодоления некоторых ограничений оригинальной методики, таких как высокая стоимость, сложность и трудность интерпретации, может быть использована матрица умеренной плотности, позволяющая просто и эффективно интерпретировать информацию о последовательности. Они выявили и описали мутации у девяти обследованных устойчивых штаммов, в то время как у одного чувствительного штамма мутаций обнаружено не было. Возможность включения дополнительных зондов к другим препаратам в ту же самую твердую основу может стать еще одним преимуществом данной методики; это, однако, не решает проблем ее стоимости, сложности и потребности в специально подготовленном персонале, затрудняющих внедрение этих технологий в условиях обычных микобактериологических лабораторий.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Популярное

Copyright © 2015. All Rights Reserved.